Von den 15 am Projekt CliSAP beteiligten Instituten gehören 13 zur Universität Hamburg. Sechs von ihnen sind Teil des ZMAW (Zentrum für Marine und Atmosphärische Wissenschaften). Das Deutsche Klimarechenzentrum (DKRZ) ist Kooperationspartner.

Die Uni-Institute:

- Meteorologisches Institut (ZMAW)

- Inst. für Meereskunde (ZMAW)

- Inst. für Biogeochemie und Meereschemie (ZMAW)

- Inst. für Hydrobiologie und Fischereiwissenschaft (ZMAW)

- Forschungsstelle nachhaltige Umweltentwicklung (ZMAW)

- Inst. für Geophysik (ZMAW)

- Biozentrum Grindel (Zoologie)

- Biozentrum Klein Flottbek (Botanik)

- Inst. für Bodenkunde

- Zentrum Holzwirtschaft

- Carl-Friedrich-von-Weizsäcker-Zentrum für Naturwissenschaft und Friedensforschung

- Centrum für Globalisierung und Governance

- Inst. für Wirtschaftssysteme

Nicht universitäre Partner:

- GKSS-Forschungszentrum Geesthacht, Institut für Küstenforschung

- Max-Planck-Institut für Meteorologie, Hamburg