Im neunten Jahrhundert ist Altenwerder historischen Akten zufolge urbar gemacht worden.

1937 erfolgte die Eingemeindung Altenwerders nach Hamburg.

Bis 1946 galt offiziell die Schreibung "Altenwärder".

Im Sommer 2002 wurde das Containerterminal Altenwerder in Betrieb genommen.