Nur dreimal kam der FC St. Pauli in den vergangenen 15 Jahren über die ersten beiden Runden im Pokal hinaus.

2009/10, 2. Runde: Werder Bremen - St. Pauli 2:1

2008/09, 1. Runde: Erzgebirge Aue - St. Pauli 5:4 n.E.

2007/08, 2. Runde: Werder Bremen II - St. Pauli 6:4 n.E.

2006/07, 1. Runde: St. Pauli - Bayern München 1:2 n.V.

2005/06, Halbfinale: St. Pauli - Bayern München 0:3

2004/05, 1. Runde: St. Pauli - Energie Cottbus 1:3

2003/04, 2. Runde: St. Pauli - VfB Lübeck 2:3 n.V.

2002/03, 2. Runde: St. Pauli - Werder Bremen 0:3

2001/02, 1. Runde: Darmstadt 98 - St. Pauli 3:1

2000/01, 2. Runde: St. Pauli - Schalke 04 1:3 n.V.

1999/00, 3. Runde: St. Pauli - SSV Ulm 1846 0:2

1998/99, 2. Runde: KFC Uerdingen - St. Pauli 6:5 n.E.

1997/98, 1. Runde: Carl Zeiss Jena - St. Pauli 5:3 n.E.

1996/97, Viertelfinale: Energie Cottbus - St. Pauli 5:4 n.E.

1995/96, 1. Runde: FC Homburg - St. Pauli 2:1 n.V.