In Folge der Zuwanderung von Muslimen seit dem 20. Jahrhundert gibt es zwei Moscheen in Elmshorn. Eine davon ist die Haci-Bayram-Veli-Moschee. Sie wurde von den Mitgliedern schräg gegenüber von der Bismarckschule an der Biernatzkistraße errichtet. Die dazugehörige Türkisch-Islamische Gemeinde wurde 1986 gegründet und umfasst derzeit 420 Mitglieder. Sie ist damit die zweitgrößte muslimische Gemeinde in Schleswig-Holstein. Der Vorsitzende der als gemäßigt geltenden Gruppe ist Ali Evcil.

Fünf Mal am Tag lädt der Vorbeter, der Imam, in die Haci-Bayram-Veli-Moschee ein. 20 bis 30 Gläubige kommen durchschnittlich zum Gebet. Weitaus mehr sind es am Freitag. Bis zu 800 von ihnen besuchen das traditionelle Gebet in der Moschee.

Die zweite Moschee in Elmshorn an der Peter-Boldt-Straße wird vom Verein Islamisches Bildungs- und Integrationszentrum getragen. In Elmshorn leben etwa 5100 Menschen muslimischen Glaubens.