Es verfügt über das bisher größte sequenzierte virale Genom und einige Gene, die typisch für Zellen sind. Dieser Befund ist höchst ungewöhnlich.

Bislang galt das Genom des Mimivirus als das größte. Es kodiert für 979 Proteine. Französische Forscher haben nun ein Virus entdeckt, dass sogar für 1.120 Proteine kodiert. Das Megavirus chilensis gilt damit als größtes Virus. Besonders an dem Riesenvirus ist auch, dass es einige Gene aufweist, die eigentlich typisch für Zellen sind. Und diese sind normalerweise streng von den Viren abzugrenzen.

Der Fund hat die Diskussion zur Herkunft der Viren neu entfacht. Ungeklärt ist bisher noch, ob Riesenviren sich zelluläre Gene angegeignet haben oder ob sie selbst aus Zellen hervorgegangen sind. Das neu entdeckte Riesenvirus chilensis spricht für letztere Theorie.