Der Grundstein für 3B Scientific wurde von Unternehmensgründer Paul Binhold 1948, damals noch als Paul Binhold Lehrmittelfabrik, gelegt. Mit der Reparatur von Puppen begann alles, bevor anatomische Lehrmittel entwickelt wurden. Den heutigen Namen trägt das Unternehmen seit 1998.

Das erste menschliche Skelett aus Kunststoff wurde von Binhold geschaffen. Vorher gab es nur echte Skelette. Das Unternehmen hat weltweit zwölf Niederlassungen mit 800 Mitarbeitern, davon 150 in Hamburg.