Das Forschungszentrum Borstel ist Mitglied der Leibniz-Gemeinschaft und gehört zur Sektion "Lebenswissenschaften". Zentrale Aufgabe des Zentrums ist die grundlagenorientierte und klinische Forschung in der Pneumologie (Lungenheilkunde).

Im vergangenen Jahr lag das Forschungszentrum Borstel in der absoluten Spitzengruppe der außeruniversitären Forschungsförderung auf dem biomedizinischen Sektor in Deutschland. Die in Borstel tätigen Wissenschaftler veröffentlichten ihre Ergebnisse in 141 internationalen Publikationen.