Die Unterläufe der Flüsse Pinnau, Krückau und Stör sind Bundeswasserstraßen. Alle drei sind tideabhängig. Unter Bundesregie steht die Pinnau (Gesamtlänge 41 Kilometer) von Pinneberg bis zur Elbe (19,2 Kilometer), die Krückau (37 km) von Elmshorn bis zur Elbe (11,3 km) und die Stör (87 km) von Kellinghusen über Itzehoe bis zur Elbe (50,2 km).