Zwölf Jahre lang hat sie die Justizvollzugsanstalt Bützow in Mecklenburg-Vorpommern geleitet. Dann wechselte Agnete Mauruschat, 53, nach Schleswig-Holstein. Im September 2013 wurde sie Leiterin der JVA in Lübeck. Bei ihrer Amtseinführung sagte die Justizministerin Anke Spooerndonk (SSW), Mauruschat verfüge „über einen enormen Wissens- und Erfahrungsschatz, von dem die schleswig-holsteinische Justiz profitieren wird“. Vor ihrer Tätigkeit in Bützow hatte Agnete Mauruschat im Justizministerium den Landes Mecklenburg-Vorpommern gearbeitet – als Referentin für Fragen der Sicherheit in Justizvollzugsanstalten.