MRSA-Infektionen zu behandeln, ist in einigen Fällen trotz der Resistenz gegen gängige Antibiotika möglich. Dies ist zum Beispiel vor einer geplanten Operation sinnvoll, jedoch nur bei bestimmten Patienten möglich. Die sogenannte Sanierung, die mehrere Tage dauert und nicht immer erfolgreich ist, ist teuer und wird bisher in der Regel nicht von den Krankenkassen bezahlt.

Eine Änderung des Infektionsschutzgesetzes, die der Bundestag im Juni beschlossen hat, sieht vor, dass ab 2012 die ambulante Therapie vergütet wird. Zudem soll die Krankenhaushygiene verbessert werden. In Deutschland sterben jährlich bis zu 15 000 Menschen an Infektionen nach einer medizinischen Behandlung. Ein Großteil dieser Krankenhausinfektionen wird durch antibiotikaresistente Erreger verursacht.