Der züchterische Ursprung des Australian Shepherd liegt, anders als der Name vermuten lässt, in Nord-Amerika, da sich dort Exemplare vieler verschiedener europäischer Hütehund-Rassen der Einwanderer, insbesondere die Hunde baskischer Schäfer mit anderen europäischen und australischen Hunden kreuzten.

Gleichzeitig wurden von Europa aus Merino-Schafe erst nach Australien exportiert und später in Amerika eingeführt, die dort den Namen "Australian Sheep" erhielten.

Ein Zuchtbuch für den Australian Shepherd wurde erst Anfang der 70er-Jahre von der 1966 gegründeten International Australian Shepherd Association (IASA) eröffnet.